Опис
Ген кальретикуліну (CALR), відповідає за синтез білка під назвою кальретикулін. Точна функція білка кальретикуліну залишається здебільшого невідомою, але він, імовірно, бере участь у забезпеченні правильного згортання нових білків, підтримці необхідного рівня кальцію в клітинах та ряді інших клітинних функцій. Мутації гена CALR пов’язані з новоутвореннями кісткового мозку, які викликають синтез занадто великої кількості клітин крові. Ці захворювання крові спільно відомі як мієлопроліферативні неоплазми (МПН). Тест на мутацію CALR знаходить аномалії в гені CALR, щоб допомогти діагностувати та класифікувати МПН.
МПН, які найчастіше асоціюються з мутаціями CALR:
- Есенціальна тромбоцитемія (ЕТ) — у кістковому мозку занадто багато клітин, що продукують тромбоцити (мегакаріоцитів).
- Первинний мієлофіброз (ПМФ), також відомий як хронічний ідіопатичний мієлофіброз або агногенна мієлоїдна метаплазія — у кістковому мозку забагато клітин, що продукують тромбоцити, і клітин, які утворюють рубцеву тканину.
Мутації CALR є другою за поширеністю генетичною аномалією (після мутацій JAK2), пов’язаною з есенціальною тромбоцитемією або первинним мієлофіброзом. Вони присутні приблизно у 20-25% дорослих з ET і 25-30% дорослих з ПМФ. Хоча ці мутації рідкісно діагностуються у дітей і є недостатньо вивченими, 50% педіатричних пацієнтів з ПМФ мали мутації CALR.
Мутація CALR на відміну від спадкових мутацій набувається після народження. Це спричинено додаванням або видаленням невеликої кількості генетичного матеріалу до ділянки гена, що називається екзоном 9. Це призводить до синтезу аномального білка кальретикуліну. Поки що не зрозуміло, як мутантний білок призводить до ознак і симптомів МПН. Хоча було виявлено понад 50 типів мутацій CALR, лише два найпоширеніші варіанти, пов’язані з МПН, включені в звичайне ПЛР-тестування.
Окрім допомоги в діагностиці МПН, тест на мутацію CALR може надати інформацію про прогноз перебігу захворювання для людини. Дослідження показали, що порівняно з особами з мутацією JAK2, у пацієнтів з мутацією CALR спостерігається легший перебіг захворювання, менше ознак і симптомів згортання крові (тромботичних епізодів) і краща виживаність.
Набір geneMAP™ CalR для скринінгу мутацій кальретикуліну – це якісний тест для виявлення 36 соматичних мутацій кальретикуліну in vitro з геномної ДНК людини та ідентифікації двох основних мутації CALR (Типу 1 та Типу 2):
- c.1092_1143del
- c.1154_1155insTTGTC
- c.1095_1140del
- c.1102_1135del
- c.1091_1142del
- c.1094_1139del
- c.1102_1153del
- c.1104_1137del
- c.1140del
- c.1154delinsTGTGTC
- [c.1092G>C;1095_1140del]
- c.1098_1131del
- c.1100_1134delinsA
- c.1101_1134del
- [c.1102_1135del;1145C>G]
- c.1102_1137delinsCA
- [c.1104_1137del;1148A>T]
- c.1104_1155del
- c.1110_1140del
- c.1118_1136del
- c.1118_1145delinsCGTTTA
- c.1120_1123del
- c.1120_1131delinsTGCGT
- c.1120_1138del
- c.1122_1141delinsA
- c.1122del
- c.1123_1125delinsTGTTT
- c.1131_1152del
- c.1135_1152delinsCCTCCTCTTTGTCT
- c.1137_1154delinsCCATCCTTGTC
- [c.1151A>G;1154_1155insTTGTC]
- c.1153_1154delinsTGTC
- c.1154_1155insATGTC
- c.1154_delinsCTTGTC
- c.1154delinsTTTGTC
- c.1155_1156insTGTCG
