Description
Олігонуклеотиди – штучно синтезовані короткі фрагменти ДНК або РНК (зазвичай від 15 до 30 нуклеотидів), які є базовим інструментом для сучасної молекулярної біології та медицини. Вони призначені для специфічної гібридизації з цільовими послідовностями та подальшого їх виявлення. Сфери застосування олігонуклеотидів включають:
- ПЛР-діагностика: ПЛР у реальному часі, класична ПЛР з гель-електрофорезом.
- Наукові дослідження: блотинг, регуляція експресії генів, антисенс-терапія.
Розрізняють:
- Немічені олігонуклеотиди (праймери), що не містять флуоресцентних міток. Застосовуються для класичної ПЛР та ПЛР у реальному часі з інтеркалюючими барвниками (наприклад, SYBR Green)
- Мічені олігонуклеотиди (ПЛР-зонди/ПЛР-проби) містять флуоресцентні мітки, що забезпечують детекцію сигналу під час ПЛР-аналізу у реальному часі.
- Модифіковані олігонуклеотиди для дослідницьких цілей (антисенс терапія-asRNA тощо)
ПРОПОЗИЦІЯ БІОНІКС ЛАБ ПО СИНТЕЗУ НЕМІЧЕНИХ ОЛІГОНУКЛЕОТИДІВ (ДНК, РНК):
Синтез ДНК та РНК олігонуклеотидів, з можливістю застосування Wobbles
Виробництво: Україна
Вид очистки: очистка знесоленням (desalted)
Шкала/масштаб синтезу:
- 50 нмоль (0,05 мкмоль). Гарантований вихід – 18 нмоль (ДНК), 10 нмоль (РНК)
- 200 нмоль (0,2 мкмоль). Гарантований вихід – 63 нмоль (ДНК), 45 нмоль (РНК)
- 1000 нмоль (1 мкмоль). Гарантований вихід – 180 нмоль (ДНК), 135 нмоль (РНК)
Термін виготовлення та доставки – 14-18 календарних днів
ПРОПОЗИЦІЯ БІОНІКС ЛАБ ПО СИНТЕЗУ МІЧЕНИХ ОЛІГОНУКЛЕОТИДІВ (ЗОНДІВ):
Флуоресцентні мітки: 6-FAM, HEX, Cy3, TAMRА
Гасники: BHQ1, BHQ2, TAMRA
Виробництво: Україна
Вид очистки: очистка ВЕРХ (HPLC)
Шкала/масштаб синтезу:
- 50 нмоль (0,05 мкмоль). Гарантований вихід – 4 нмоль (ДНК)
- 200 нмоль (0,2 мкмоль). Гарантований вихід – 12 нмоль (ДНК)
ПРОПОЗИЦІЯ БІОНІКС ЛАБ ПО СИНТЕЗУ МОДИФІКОВАНИХ ОЛІГОНУКЛЕОТИДІВ :
Під індивідуальний запит можливий синтез олігонуклеотидів з:
- модифікаціями основ : O-Me-RNA, LNA та ін.
- модифікаціями на 5’ та 3’ кінцях : Фосфат, Пуроміцин та ін.
- внутрішніми модифікаціями : dT-AminoModifierC6, PS linkage, Spacer9 та ін.
Важливо зауважити, що вартість залежить від кількості кроків і шкали синтезу.
За детальною інформацією та отримання комерційної пропозиції на синтез зв’яжіться з Вашим персональним менеджером.
Q&A
Що таке шкала/масштаб синтезу. В чому відмінність між масштабом синтезу та гарантованим виходом?
Шкала синтезу/масштаб синтезу (synthesis scale) – це кількість вихідного матеріалу (у нмоль), який використовується як матриця для синтезу на першому етапі. Натомість на кожному циклі синтезу відбуваються втрати матеріали, фінальний вихід продукту залежить від довжини та послідовності ланцюга, обраного методу очистки, наявності модифікацій тощо.
Ми пропонуємо синтез олігонуклеотидів із масштабом синтезу 50 нмоль, 200 нмоль та 1 мкмоль, які відрізняються гарантованим виходом.
Гарантований вихід (guaranteed yield) – це мінімальна кількість олігонуклеотиду, яку ви отримуєте.
Наприклад, для неміченого олігонуклеотиду (до 45 кроків) з масштабом синтезу 50 нмоль з очисткою знесоленням гарантований вихід становить 18 нмоль, з очисткою HPLC – 6 нмоль.
Який метод очистки обрати?
Ми пропонуємо два види очистки: знесоленням та ВЕРХ (HPLC).
Знесолення(desalting) – базовий метод очистки, призначений для видалення низькомолекулярних домішок (залишок захисних груп, солей і тд.) Забезпечує високий вихід із чистотою продукту ≈ 80%.
HPLC (high-performance liquid chromatography) – ефективний метод, що розділяє олігонуклеотиди за масою та хімічними властивостями. Забезпечує високу чистоту(≈90- 95%), разом з тим втрати матеріалу складають до 80%.
Очистка знесолення підходить для немічених праймерів.
Очистка HPLC обов’язкова для мічених олігонуклеотидів (ПЛР-зондів), разом з тим її також можна застосовувати для немічених олігонуклеотидів.
Як зробити замовлення?
Заповніть форму замовлення, вказавши усю необхідну інформацію: масштаб синтезу, тип фасування, вид очистки, послідовність для синтезу, контроль якості (базово Mass Check) та надіславши її Вашому персональному менеджеру або звернувшись на пошту bionix@bionixlab.com.
Чи пропонує БІОНІКС ЛАБ послугу дизайну праймерів?
Ні, фінальне рішення щодо вибору послідовностей для синтезу лишається за клієнтом
